L'utilizzo delle risorse è subordinato alla presentazione di progetti da parte dei comuni beneficiari. La procedura è disciplinata dall'Accordo tra amministrazioni dell'8 dicembre 2015. Per sbloccare le risorse a partire dal 2013, secondo quanto dettato dalle linee guida approvate con decreto del Presidente della Giunta Regionale 2333/2013, si procede alla sottoscrizione di atti integrativi, a cominciare dal disciplinare per la progettazione dei lavori. Il tavolo tecnico ha apportato anche delle variazioni all'Accordo, utili a semplificare e velocizzare la procedura di utilizzo delle risorse, prima piuttosto farraginosa. 

I fondi sono vincolati: la legge prescrive che vengano impiegati per infrastrutture a supporto delle attività produttive o per il miglioramento ambientale, e questo crea qualche difficoltà ai piccoli comuni, in mancanza di una specifica vocazione produttiva.

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